Предсказание кривых малоуглового рентгеновского рассеяния для человеческих трансглутаминаз

Аннотации

Аннотация

Трансглутаминазы (ТГазы) являются уникальной группой ферментов, которые способствуют посттрансляционной модификации белков, образуя изопептидные связи. Понимание того, что разнообразные процессы, такие как нормальный и опухолевый рост клеток, репродукция и смерть клеток, зависят от достаточного уровня трансглутаминаз и что эти ферменты могут влиять на дифференцировку и пролиферацию различных типов клеток, побудило многих  исследователей изучать эти увлекательные молекулы. Кроме того, трансглутаминазы играют роль во многих заболеваниях, включая целиакию и неврологические расстройства. У млекопитающих на геномном уровне были идентифицированы девять различных изоферментов ТГаз. Однако только малое количество этих белков обладает надежными структурами для будущих исследований, в то время как большинство имеет только частично разрешенные структуры. Мы предсказали открытые и закрытые конформации TГ1, TГ3, TГ4, TГ5, TГ6, TГ7 с использованием AlphaFold и рассчитали теоретические кривые МУРР для каждой модели с помощью программного обеспечения CRYSOL. Более того, мы продемонстрировали возможность различать открытые и закрытые конформации TГ1 с использованием МУРР.