Веб-сервис для автоматизированной детекции и анализа радиационно-индуцированных фокусов в ядрах клеток

Авторы

  • С. Шадмехри Объединенный институт ядерных исследований, Дубна, Россия
  • Т. Ж. Бежанян Объединенный институт ядерных исследований, Дубна, Россия; Государственный университет «Дубна», Дубна, Россия
  • М. Ю. Бондарев Объединенный институт ядерных исследований, Дубна, Россия; Государственный университет «Дубна», Дубна, Россия
  • О. И. Стрельцова Объединенный институт ядерных исследований, Дубна, Россия; Государственный университет «Дубна», Дубна, Россия
  • М. И. Зуев Объединенный институт ядерных исследований, Дубна, Россия
  • А. В. Борейко Объединенный институт ядерных исследований, Дубна, Россия; Государственный университет «Дубна», Дубна, Россия
  • Т. С. Храмко Объединенный институт ядерных исследований, Дубна, Россия; Государственный университет «Дубна», Дубна, Россия
  • М. Е. Крупнова Объединенный институт ядерных исследований, Дубна, Россия

Аннотация

Для автоматизации анализа радиационно-индуцированных фокусов (РИФ) на флуоресцентных изображениях разработан двухэтапный алгоритм на базе методов глубокого обучения: на первом этапе для обнаружения ядер клеток на каждом изображении используется предварительно обученная нейронная сеть SAM2, на втором этапе для обнаружения фокусов в каждом ядре клетки применяется нейроcетевая модель YOLO, обученная на основе данных с аннотированными фокусами. На основе разработанного алгоритма создан веб-сервис на платформе Writer Framework, функционал которого позволяет пользователю видеть все детектированные ядра клеток на загруженном флуоресцентном изображении, отбирать объекты для анализа, автоматически получать отмеченные фокусы на каждом изображении и получать числовые характеристики, такие как количество РИФ на ядро и др.

Загрузки

Опубликован

2026-10-19

Выпуск

Том 57 № 4 (2026): ЭЧАЯ

Раздел

Статьи