Оптимизация открытых кодов квантовой химии на суперкомпьютере «Говорун»: применение к адсорбции сверхтяжелых элементов

Аннотации

Аннотация

Стремительное развитие вычислительной молекулярной физики зависит от эффективной адаптации программного обеспечения к платформам высокопроизводительных вычислений. Представлен систематический бенчмаркинг двух основных пакетов с открытым исходным кодом: DIRAC для релятивистской теории электронной структуры молекул и Quantum ESPRESSO для моделирования периодических задач теории функционала плотности на суперкомпьютере «Говорун». Рассмотрены различные конфигурации сборки, схемы распараллеливания и реализации на базе графических процессоров для оценки масштабируемости, производительности памяти и вычислительной пропускной способности.