Поиск взаимодействующих атомов в оценочной функции с использованием GPU-вычислений
Аннотация
В данной работе рассматривается функция для оценки энергии взаимодействия белок-белковых комплексов. Приведены результаты сравнения различных подходов к начальному этапу вычисления энергии взаимодействия, включающему выбор всех пар атомов, находящихся в пределах заданного порогового расстояния. Проанализированы два подхода с использованием CUDA-ядер и тензорных ядер с учетом специфики задачи.
